根据教育部普通高等学校人文社会科学重点研究基地建设要求及教育部专家组实地考察评估后提出的基地整改意见,中心结合自身的研究优势,组织制订了《少数民族教育研究“十一五”规划》。规划分三个部分,一是总结了十五期间本学科领域研究概况;二是分析“十一五”期间本学科领域的发展趋势、主要目标任务和重点研究领域;三是“十一五”期间本基地的重点研究课题及简要论证。规划提出“十一五”期间中心将形成以下重点研究领域:1、民族教育学理论体系的研究与构建。2、民族地区基础教育问题研究。3、少数民族高等教育问题研究。4、民族教育的特殊政策研究。5、民族地区双语教学的模式研究。6、民族地区多元文化课程问题研究。7、多元文化教育理论的国际比较研究。8、民族认同与民族地区青少年心理教育问题研究。9、民族教育事业管理理论研究。规划进一步明确了“十一五”期间本基地的九大重点研究课题,分别是:1、民族地区普及义务教育的问题与对策研究2、民族地区寄宿制学校发展研究3、民族地区基础教育课程改革的特点与难点研究4、从藏传佛教与现代学校教育发展的关系研究5、伊斯兰教与回族地区学校教育发展的关系6、民族地区青少年民族认同、国家认同与公民教育7、中国多元文化教育史研究8、西方多元文化教育比较研究9、中国少数民族教育与西方多元文化教育比较研究。目前该规划以上报教育部。